1234年蒙古孛儿只斤窝阔台灭金朝的残酷屠和毁城,使这一地区变成荒原。1650年,清顺治七年三姓屯一带有农民定居耕种。进入19世纪以后,随着“京旗移垦”和“开禁放荒”,大量满、汉族人移居此地,新的材落又逐步形成和发展,延续到今。
1662年,康熙元年,宁古塔驻军晋为宁古塔将军。
1757年,乾隆二十二年,宁古塔将军改称吉林将军,道里地区则隶属吉林将军治下阿勒楚喀副都统衙门管辖。
1946年道里区隶属哈尔滨市管辖。
1956年10月道里区与顾乡区合并为新的道里区,仍为哈尔滨市的一个行政区,延续到今。