1871年7月通过废藩置县，将所有的藩统一改称为县，形成美浓九县、飞驒一县。同年11月，美浓一带全部统称为岐阜县，高山县被列入筑摩县（即长野县）。

1876年，高山县被划出筑摩县列入岐阜县，2005年长野县的山口村也被并入岐阜。市町村总数由于公元1868年至公元1911年（明治）、1926年12月25日至1989年1月7日（昭和）年间的大合并，1889年共948市町村，1960年锐减为106市町村。