1996年，兴寿乡面积35.4平方千米，人口1.3万，上苑乡面积52平方千米，人口1万人。

1997年12月，市政府同意昌平县撤销下庄乡、上苑乡和兴寿乡，合并设立兴寿镇，镇政府设在兴寿村；2002年末，面积157平方千米，人口2.64万人，2006年末，面积157平方千米，人口2.71万人。

2011年，昌平区北部山区规划调整，将兴寿镇北部的9个山区村（原下庄乡以及原上苑乡的连山石村）与原长陵镇部分山区合并设立延寿镇，兴寿镇保留半山区与平原村共计21个。