1649年（清顺治六年）前后，达斡尔族人在这里建屯。
1890年（清光绪十六年）前后属镶红旗。解放初期为龙江县第一区，是龙江县政府所在地。
1954年划归齐齐哈尔市，为县级行政区，现区人民政府驻地和平路137号。
“富拉尔基”是达斡尔语“呼兰额日格”的转音，意为“红色的江岸”。故富拉尔基别称“红岸”，区标红宝石。
1649年（清顺治六年）前后，达斡尔族人在这里建屯，以打鱼为生。
1890年（清光绪十六年）前后属镶红旗。红岸已历三百余年历史沧桑。
1931年9月18日，“九·一八”事变后东北三省步步沦陷，辽宁、吉林两省沦陷后日军向黑龙江步步紧逼。黑龙江省省会齐齐哈尔频频告急。
1931年10月，日军指使汉进犯黑龙江省省会齐齐哈尔。黑龙江省代省主席马占山率部在泰来平齐铁路嫩江桥英勇抵抗，打响了中国及世界反法西斯战争第一**。江桥抗战失利后，黑龙江省局势混乱。齐齐哈尔于1931年沦陷。
1932年11月10日晨，日军第十四师团重新组织冈原支队上千人，在飞机、装甲车的掩护下，向富拉尔基进攻，被救国军和当地红**会轻机**队击溃，毙伤70余人。翌日晨，冈原支队和一部分伪军，在飞机、大、装甲车的掩护下再次向富拉尔基大举进攻。护国军与日伪军激战四昼夜，终因弹药耗尽被迫撤至朱家坎（今龙江县）。富拉尔基终被日军占领。并开始了在日本侵略者铁蹄下长达13年的殖民统治。
1945年8月15日富拉尔基解放，解放初期为龙江县第一区，是龙江县政府所在地。
1954年10月，划归齐齐哈尔市管辖，设置市辖富拉尔基区。
1955年9月，龙江县政府移往朱家坎镇（后改为龙江镇）。
1996年，富拉尔基区辖9个街道、3个乡：红岸街道、兴隆街道、沿江街道、铁北街道、北兴街道、科研街道、电力街道、幸福街道、梅里斯街道、长青乡、富国乡、杜尔门沁达斡尔族乡。