汉置武阳县井研镇。
东晋置西江阳郡，北朝西魏于今地置蒲亭县，属陵州。
隋开皇十一年（591年）立隆山郡，废蒲亭置井研县。
从隋开皇十一年（591年）建县起，经唐、宋至元朝初期的六百多年，县域有所扩大。
宋真宗咸平四年（1001年）将始建县（即今仁寿县彰加地区）并入井研县。
元世祖至元二十年（1283年），则隆州井研并省为仁寿，人成都路，县境域为仁寿四乡之一，曰来凤”于明朝洪武六年（1373年）太祖朱元璋下诏，撤仁寿县的来凤乡，恢复井研县。
清顺治初归资州，属成都府。
雍正五年（1727年）升资州为直隶州。
民国二十四年（1935年）属第二行政督察区（区治地资中城关镇）。
1949年后，井研县一直归属乐山市（前乐山地区）。