周，秦时期均属肃慎族部落。
汉，晋为挹娄部。
北魏时代依兰是勿吉国中心。
隋朝时勿吉改称靺鞨。
唐时靺鞨共七部，其中粟末部日趋强大，于圣历元年，698年，创立震国，唐于开元元年，713年，册封其首领大祚荣为渤海郡王，国名渤海。
辽继承渤海领土主权，废除州县建制。
金设路治，称胡里改路。
元朝建立后，依兰初属辽阳行中书省开元路，后由开元路划出归合兰府水达达路管辖。
明初属三万卫辖区。
清顺治兰年，1645年，为加强三姓地方驻防兵力，将从征山东的三姓部分兵丁千余人撤回三姓。
清康熙三年，1664年，初设三姓城。
清乾隆十七年，1752年，撤宁古塔将军，三姓副都统改山吉林将军统辖。
清光绪八年，1882年，设富克锦协领衙门，属三姓副都统，统归吉林将军。
光绪三十一年，1905年，置依兰府，撤三姓副都统衙门。
光绪三十三年，1907年，改革东北行政制度划分三省，依兰辖于吉林省。
民国2年，1913年，改东北路分巡兵备道为依兰道。初辖依兰、
1945年解放后，先辖于合江省，后隶属于松江省。
1954年松江省与黑龙江省合并，成立黑龙江省，依兰县隶属黑龙江省。
1991年4月1日，划归哈尔滨市管辖。