明英宗天顺元年又由当时的知州宋城改建成大楼，至神宗万历知州刘顺元又重修。
天启四年，因黄河决口，州城被水淹没，鼓楼毁于洪水。
明嘉靖二十二年又由王重贤重建，后再因年久失修而倒塌。
公元1848年（清道光二十八年），又在原址依照旧观复建，楼基下用大砖砌成，形如城门，过往行人车马均得从门洞穿过。据记载，当时门洞四周出厦，起脊排角，雄伟壮观。并在南面匾额上书有“中枢巨镇”，彰显徐州为“五省通衢”的盛名。北面匾额上“大观至上”说明景观独秀。
1937年，抗日战争以前，楼上还设有图书馆，供人游览阅读，后毁于暴风雨。因年久失修。
1952年又遇暴风雨灾害，后楼毁塌方，成为危楼而被拆除，从此不复存在。当时紧邻鼓楼的是苏姑墓，即在原市机关北大院内，现为鼓城路一号，墓高一米有余，据区志记载：“在州廨内，相传苏轼守徐州时，葬幼女于此。她曾舍身跳水，拯救徐州百姓，为世人所敬仰。”
清康熙十七年（1678年），松江府水利通判董宏署执政，修亭覆盖，墓门复勒石碣。
康熙五十八年，由知州姜焯重修，乾隆年间又由知府石杰再修，后人于墓前显像以礼。现虽誉满彭城，但遗迹无存。徐州鼓楼区因境内有鼓楼而得名，为徐州市的中心城区，也是市区最古老的城区。
日本帝国主义侵占徐州后，建立了日伪政权，那时，徐州划为4个行政区，今徐州鼓楼区即当时的第一区。
1946年废除乡镇建制时，曾又将徐州划为5个区。
1948年12月徐州解放后，仍维持原来的行政区划。
中华人民共和国成立后，第一区的名称一直沿用到1955年。后因境内有古代建筑鼓楼，经上级批准，将第一区更名为徐州鼓楼区。
1966年，在“文化大革命”中以破四旧为名，将徐州鼓楼区改名为延安区。
1980年又恢复徐州鼓楼区的名称。