西汉惠帝三年（前192），立越王勾践七世孙驺摇为东海王，都东瓯（今温州市），为东瓯国土。始元二年（前85），以东瓯地置回浦县，属会稽郡，为回浦县地。

东汉建武初（25），省回浦入鄞县。章和元年（87）析回浦故地置县，名章安，为章安县地。建安四年（199），分章安县南乡置松阳县，仍属会稽郡，为松阳县地。三国吴太平二年（257）分会稽郡东部置临海郡，松阳县属之。东晋太宁元年（323）分临海郡置永嘉郡，松阳县属之。历南朝宋、齐、梁、陈不变。

隋开皇九年（589），废临海、永嘉二郡为县，分松阳东乡置括苍县，置处州，治设括苍。十二年（592），改处州为括州。大业三年（607），括州改称永嘉郡。

唐武德四年（621），复为括州，括苍、丽水二县属括州。八年（625）省丽水入括苍。万岁登封元年（696）分括苍、永康两县地置缙云县。景云二年（711），析括苍置青田县。天宝元年（742），改括州为缙云郡。乾元元年（758）复改郡为州，括苍属括州。大历十四年（779），避德宗讳，改括州为处州，改括苍县为丽水县。《元和郡县志》：“丽水本名恶溪，以其湍流阻险，九十里间五十六濑，名为大恶，隋开皇中，改为丽水，皇朝因之，以为县名”。《名胜志》：“以县北七里有丽阳山，故以丽水为名”。《栝苍汇纪》：“县北七里有丽阳山，下环清溪，县名丽水以此。”

五代十国，莲都区为吴越国地，属处州。太平兴国三年（978），吴越归宋，州县沿前代。

元至元十三年（1276），改州为路，丽水属处州路。

明代改路为府，莲都属处州府。景泰三年（1452），分丽水浮云乡、元和乡之半置云和县；析宣慈乡、应和乡及懿德乡之半置宣平县。

清代莲都属处州府，直至宣统三年（1911）七月，除丽水县，划归府兼理。自隋建州设县以来，丽水历为州、郡、路、府治所。

1911年（清宣统三年）11月25日，光复军光复丽水，立处州军政分府，兼理丽水县事，上隶浙江军政府。

中华民国三年（1914）行省、道、县三级制，丽水县属瓯海道。

民国十六年废道，行省、县二级制，丽水县直属省。

民国十九年省分设县政督察区，属第十一区，后改第二特区。

民国二十四年，改设行政督察区，丽水县属第九行政督察区。

民国三十七年4月，改第六区，七月改第七区。丽水县均为督察专员公署驻地。

1949年5月10日，丽水县解放，属浙江省第七专区。

1949年10月1日，中华人民共和国成立，丽水县属丽水专区。

1950年4月，县府迁驻碧湖镇。

1952年1月，撤丽水专区，丽水县属温州专区。5月13日。县府迁返城关镇。

1958年7月、1960年2月，云和、景宁两县先后并入。

1961年6月1日，县府迁驻云和镇。

1962年4月分云和县，县府迁返城关镇。

1963年5月，复设丽水专区，丽水县属丽水专区，仍为专署驻地。

1968年11月专区改称地区，丽水县属丽水地区。

1986年3月1日，国务院批准撤丽水县置丽水市，仍属丽水地区。

2000年6月6日，国务院批准撤消县级丽水市，设立莲都区，以原县级丽水市的行政区域为莲都区的行政区域。莲都区为新设立地级丽水市的驻地。

地名由来

莲都区名的由来是因丽水城依山傍溪，在环山之中，形如莲瓣，宋代以后别名莲城，丽水又特产“处州白莲”，定“莲都”为市辖区区名，意欲将美丽的莲都建成繁华的都市。此一区名系从全丽水地区2000多参与区名征集者中精选所得。