庵埠镇古称龙溪都，置于宋元丰（1078-1085年）之前，此名一直延续到民国，属揭阳县或海阳县。

1914年海阳更名潮安，一直归属之。

民国初分为内龙溪和外龙溪区，1930年实行分区自治，改称为第八区，1939年又改称龙溪区，同时改溪中镇为庵埠镇，此后数次于第八区和龙溪区之间更改。

1950年置庵埠镇。

1958年成立庵埠人民公社，1983年撤人民公社，置庵埠区和庵埠镇，潮安县并入潮州市，因此庵埠归属潮州市，1987年撤区，总称庵埠镇，1991年，经国务院批准，在潮州市升格扩大区域（辖潮安县、饶平县、湘桥区）的同时，恢复潮安县。县城设于枫溪镇。

1992年潮安县城改设于庵埠镇。