梁朝（502年后），江都县历北齐、陈、北周，时废时置。北齐、北周复立江都县时，均隶属江阳郡。

隋开皇初年（581年后），江都县属吴州。

隋开皇九年（589年），直属扬州。

隋大业元年（605年），隶属江都郡。

唐武德三年（620年），江阳县并入，江都县又划分至兖州。

唐天宝元年（742年后），江都县又先后隶属广陵郡、江都府。

宋至道三年（997年），江都县属淮南东路，与广陵县同属扬州府，史称“一府两县”。

元至正十七年（1357年），朱元璋占领南京后，江都县先后隶属淮海府、维扬府、扬州府。

清雍正九年（1731年），析江都以西之地为甘泉县，同受治于扬州府。

1911年底，甘泉县又并入江都县。

江都县抗日民主政府成立后，为适应革命斗争形势的需要，曾三次以通扬运河为界分县：

1942年9月，第一次分县，通扬运河北称江都县，通扬运河南称邗东县，1943年4月两县合并称江都县；1945年4月两县合并称江都县；1948年11月第三次分县，河北称江都县，河南又称邗东县，1949年1月两县合并仍称江都县。建国后，江都县治所设于仙女镇，江都县的辖境包括邗江区。

1956年设仙女镇以西之地为邗江县。

1994年7月，江都撤县设市。

2011年11月13日，经国务院批准，正式撤市设区，称为扬州市江都区。