明洪武十九年（1386年），为防倭寇侵扰，建城置金山卫，卫治在金山卫城，仍属华亭县。
清初属娄县、华亭县。雍正四年（1726年）分属金山、华亭县。
清雍正四年（1726年）至乾隆二十三年（1726—1758年），为金山县治。
清乾隆三十三年至嘉庆元年（1768—1796年），复作金山县治。
民国二年（1913年）至三十八年（1949年）四月，属金山县。
1957年，西门、大石、新扶、典浦乡四乡合并建金卫乡。
1958年称金卫人民公社。
1966年山阳公社的农建、金卫生产大队划入金卫人民公社。
1984年恢复分建置。
1993年4月，撤乡建镇，名为金山卫镇。
2001年3月，撤销原金山卫镇、钱圩镇，建立新的金山卫镇，属金山区下辖镇。