隋开皇十年（590年），改庐陵郡为吉州，新建州城于今市区赵公塘一带，境内属庐陵县，为吉州首府。唐永淳元年（682年），废赵公塘（堂）旧城，新建州城于今市区北门街道辖区内，并将庐陵县治从石阳古城迁入。天宝元年（742年），改吉州为庐陵郡。乾元元年（758年），复改庐陵为吉州。

宋太宗淳化三年（992年）改为吉州军。元至元十四年（1277年）废吉州军改称吉州路。元元贞元年（1295年），改吉州路为吉安路。明洪武元年（1368年），改吉安路为吉安府。庐陵县为历代州、路、府治所。

1914年废吉安府为吉安县，属于庐陵道（治宜春）。

1926年，废庐陵道，吉

安县直属江西省。

1932年，置第九地政区公署于吉安。

1939年，改第九行政区为第三行政区。

1979年11月，吉安县治所从吉安市区徙新县城敦厚镇。

1985年6月19日，吉安市白塘乡和青塘乡合并改名为白塘乡。

1993年11月17日，吉安市撤销天玉乡、兴桥乡，设立天玉乡、兴桥镇。

1996年3月19日，吉安市撤销樟山乡、长塘乡、河东乡，设立樟山镇、长塘镇、河东镇。

1999年6月25日，撤销吉安市水上办事处，其所辖居民按属地管理原则划分并移交。

2000年，全区辖5个街道、3个镇、3个乡。

2000年5月11日，撤销吉安地区和县级吉安市，设立地级吉安市，市政府驻吉州区。吉安市设吉州区、青原区。吉州区辖原县级吉安市的古南镇、永叔、文山、习溪桥、北门5个街道办事处和白塘乡、禾埠乡、长塘镇、兴桥镇、樟山镇以及从吉安县划入的曲濑乡，区政府驻阳明东路。

2001年12月4日，吉州区撤销白塘乡建制，设立白塘街道办事处。