秦汉时设犍为郡，洪雅东北大部分地区为南安县，属犍为郡，县西南部分地区属严道县；

晋、南北朝时，洪雅地曾先后属齐乐郡、益州、齐通郡、青州、眉州、嘉州；

唐朝武德元年（618年）和开元七年（719年）先后在此设置犍州、义州，以僚户置南安（今夹江县西部）、平乡二县属之，不久州废，仍复原县。

宋时期属眉山郡，改嘉州为府后，属嘉定府；

元朝并入夹江县，属嘉定路。1482年（明成化十八年）复置为洪雅县，仍辖原有区划，属嘉定州；

清代属嘉定府；

1912年（民国元年），废府、厅、州，四川分设七道，洪雅属上川南道，后又改建昌道；

1919年（民国八年），四川军阀各占地为防区，洪雅先后为川军第3军（陈洪范师）、24军、21军防区。

1935年（民国二十四年），川政统一，洪雅属第四行政督察区。

洪雅县解放后，属川西区的眉山专区，1953年属乐山专区。

1958年，丹棱县并入洪雅。

1962年11月，仍恢复为原洪雅、丹棱二县，俱属乐山专区，后改为乐山市。

1997年8月，洪雅划归眉山地区。

2000年，洪雅县辖12个镇、14个乡。

2003年6月23日，洪雅县撤销吴庄乡，将其所属行政区域并入瓦屋山镇；瓦屋山镇人民政府驻地由张坝迁至吴庄。

2004年，洪雅县辖12个镇13个乡。

2005年4月30日，四川省人民政府批复洪雅县撤销新庙、符场、金釜、联合、柳新、天宫、赵河、吴河、张村9个乡和槽渔滩镇，扩大8个镇的行政区域：　将原新庙乡所属行政区域并入洪川镇。洪川镇政府驻洪川。将原符场、金釜2个乡所属行政区域并入余坪镇。余坪镇政府驻余坪。将原柳新、天宫2个乡所属行政区域并入东岳镇。东岳镇政府驻东岳场。将原赵河乡所属行政区域并入柳江镇。柳江镇政府驻柳江场。将原吴河乡所属行政区域并入高庙镇。高庙镇政府驻高庙。将原张村乡所属行政区域并入瓦屋山镇。瓦屋山镇政府驻吴庄。将原联合乡所属行政区域并入中保镇。中保镇政府驻中保。将原槽渔滩镇所属行政区域并入罗坝镇。罗坝镇更名为槽渔滩镇，镇政府驻罗坝。

2005年，洪雅县辖洪川、止戈、三宝、余坪、槽渔滩、中保、东岳、花溪、柳江、高庙、瓦屋山11个镇和中山、将军、汉王、桃源4个乡。

2013年1月9日，四川省政府同意洪雅县政府驻地由洪川镇人民路2号迁至洪川镇瓦屋山大道126号。