黄岩故地在夏、商、周为东瓯地。

春秋战国为东瓯王国。

秦代属闽中郡。

汉代属回浦县、章安县、永宁县。

三国、两晋至南朝属临海县。

唐代上元二年（657）始设永宁县，唐武后天授元年（690）改名为黄岩县，因中国道教名人王方平隐居之山顶有黄石而得名。

元代元贞元年（1295），升为黄岩州。

明初洪武二年（公元1369年），复县。

1989年11月，经国务院批准设立黄岩市。

1992年撤区并乡扩镇，从55个乡镇合为26个乡镇。

1994年12月，台州地区撤地易地设市，黄岩撤市设区，为台州市的主体城区之一。

1996年，黄岩区面积998平方千米。辖9个镇、7个乡，区政府驻城关镇。